[シェフ]

なるほど、理解しました。
管理サイトを見たところ、テーマカスタマイザーに表示されるウィジェットエリアは、規則性はわからないものの特定のエリアが表示されるわけではないようなので、ウィジェットアイテムを空にしたり、適当なものを追加したりすることで、テーマカスタマイザーに希望のウィジェットエリアを表示することができると思います。
表示するウィジェットエリアをコントロールする方法については、WordPressのコアファイルを見て考えてみますが、お役に立てるかどうかわからないので、4月1日に間に合わせるには先ほどのやり方を試した方が良いかもしれません。